脊索动物门分为3个亚门，10个纲，3个亚门别离为尾索动物亚门、头索动物亚门、脊椎动物亚门。脊索动物门是动物界更高等的一门，也是开展得最胜利的一类。其配合特征是在其个别发育全过程或某一期间具有脊索、背神经管和鳃裂。

脊索动物：

无疑是由无脊椎动物起源的。而此中的棘皮动物和半索动物与脊索动物的亲缘关系较近的概念为大大都人所承受。经揣测，脊索动物的祖先可能类似于尾索动物的幼体，它向两个标的目的开展，一是颠末反常，成体为固着生活，具鳃裂做为取食和呼吸器官；另一个标的目的是幼体期耽误并适应新的生活情况，不再反常，产生生殖腺并停止繁衍（即幼体性成熟），进而开展出新的一类动物，即具有脊索、背神经管和鳃裂的自在运动的脊索动物；之后分化为有颌类（鱼类祖先）和无颌类。脊索位于消化道和神经管之间的一条棒状构造，具有撑持功用，所有脊索动物的胚胎期具有脊索，但在以后的生活中或末生保留（尾索动物亚门、头索动物亚门），或退化并被脊柱取代。